在 Igor Pro 中,進(jìn)行層次分析(Hierarchical Analysis)通常涉及數(shù)據(jù)的分層處理、分組、以及通過(guò)聚類(lèi)方法(如層次聚類(lèi))對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。這種分析方式常見(jiàn)于探索性數(shù)據(jù)分析(Exploratory Data Analysis, EDA),尤其是在處理多維數(shù)據(jù)集時(shí)。
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層次分析的實(shí)現(xiàn)可以通過(guò)以下幾種方法來(lái)進(jìn)行:
1. 層次聚類(lèi)(Hierarchical Clustering)
層次聚類(lèi)是一種常見(jiàn)的無(wú)監(jiān)督學(xué)習(xí)方法,它將數(shù)據(jù)點(diǎn)分成多個(gè)層次,通過(guò)樹(shù)形圖(dendrogram)表示這些層次之間的關(guān)系。在 Igor Pro 中,層次聚類(lèi)可以通過(guò) Cluster 函數(shù)進(jìn)行。
步驟:
準(zhǔn)備數(shù)據(jù): 假設(shè)你有一個(gè)多維數(shù)據(jù)集,其中每一行表示一個(gè)樣本,每一列表示一個(gè)特征。你可以將這些數(shù)據(jù)存儲(chǔ)為矩陣或表格。
// 創(chuàng)建數(shù)據(jù)矩陣,例如 10個(gè)樣本和5個(gè)特征
Make/O data = 10, 5
// 填充數(shù)據(jù)
for (i = 0; i < 10; i++) {
for (j = 0; j < 5; j++) {
data[i, j] = Random() // 填充隨機(jī)數(shù)據(jù)
}
}
進(jìn)行層次聚類(lèi): 使用 Cluster 命令對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行層次聚類(lèi)。此命令通過(guò)計(jì)算樣本間的相似度(通常使用歐幾里得距離或其他距離度量)來(lái)執(zhí)行聚類(lèi)。
繪制樹(shù)形圖: 聚類(lèi)完成后,你可以繪制樹(shù)形圖來(lái)可視化層次聚類(lèi)的結(jié)果。
Display ddata // 顯示聚類(lèi)的樹(shù)形圖(dendrogram)
功能:
自定義距離度量:你可以在進(jìn)行聚類(lèi)時(shí),指定不同的距離度量方法(如歐幾里得距離、曼哈頓距離等)。
Cluster data, Distance=Euclidean
設(shè)置聚類(lèi)方法:你還可以設(shè)置聚類(lèi)方法(例如單鏈接、完全鏈接等)。
Cluster data, Method=Complete
2. 層次數(shù)據(jù)的樹(shù)形結(jié)構(gòu)分析
除了層次聚類(lèi),層次分析還涉及將數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化為樹(shù)形結(jié)構(gòu),進(jìn)行逐層分析。你可以手動(dòng)創(chuàng)建樹(shù)形結(jié)構(gòu)(如通過(guò)遞歸函數(shù))來(lái)表示不同層次的數(shù)據(jù)分組。
步驟:
創(chuàng)建樹(shù)形結(jié)構(gòu):假設(shè)你有一個(gè)層次結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)集,可以創(chuàng)建一個(gè)包含多個(gè)節(jié)點(diǎn)的樹(shù)。
// 示例:每個(gè)節(jié)點(diǎn)表示一個(gè)數(shù)據(jù)集,嵌套表示層次關(guān)系
Variable parent, child
parent = "Root"
child = "Child1"
遞歸分析:通過(guò)遞歸方法對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行層次處理,按層次逐級(jí)分析。你可以編寫(xiě)遞歸函數(shù)來(lái)分析數(shù)據(jù)。
Function RecursiveAnalysis(node)
// 執(zhí)行某些操作,如計(jì)算該層次的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)信息
Print "Analyzing node: ", node
End
調(diào)用遞歸函數(shù):
RecursiveAnalysis(parent)
3. 基于分組的層次分析
除了聚類(lèi)分析,層次分析還常用于分組數(shù)據(jù)。在這種情況下,你可以通過(guò)將數(shù)據(jù)分組、篩選和匯總等步驟來(lái)進(jìn)行層次分析。
步驟:
分組數(shù)據(jù):假設(shè)你有一組數(shù)據(jù),基于某一屬性進(jìn)行分組,例如按照類(lèi)別分組。
Variable categories[] = {"A", "B", "A", "C", "B", "C", "A"}
Make/O data = 7, 5
// 填充數(shù)據(jù)
for (i = 0; i < 7; i++) {
for (j = 0; j < 5; j++) {
data[i, j] = Random()
}
}
按類(lèi)別進(jìn)行分組:使用 Group 命令將數(shù)據(jù)按照類(lèi)別進(jìn)行分組,并對(duì)每組進(jìn)行分析。
Group categories, data
計(jì)算每組的統(tǒng)計(jì)信息:例如,你可以計(jì)算每組數(shù)據(jù)的均值、方差等統(tǒng)計(jì)量。
Variable mean_A = Mean(data, "A")
Variable mean_B = Mean(data, "B")
4. 層次分析中的統(tǒng)計(jì)分析
除了聚類(lèi)和分組外,層次分析還常常結(jié)合統(tǒng)計(jì)分析進(jìn)行,尤其是在處理多個(gè)層次的數(shù)據(jù)時(shí)。你可以計(jì)算每個(gè)層次的均值、標(biāo)準(zhǔn)差等統(tǒng)計(jì)指標(biāo),進(jìn)而進(jìn)行數(shù)據(jù)比較和可視化。
步驟:
計(jì)算每個(gè)層次的統(tǒng)計(jì)量: 你可以使用 Mean、StdDev 等命令來(lái)計(jì)算每個(gè)層次數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)特征。
Variable groupMean = Mean(groupData)
Variable groupStd = StdDev(groupData)
繪制統(tǒng)計(jì)圖表:繪制每個(gè)層次的統(tǒng)計(jì)圖表,幫助分析不同層次之間的差異。
Display groupMean, groupStd
5. 結(jié)合其他分析方法
層次分析常常與其他分析方法結(jié)合使用,例如:
主成分分析(PCA):通過(guò)主成分分析降維后,再進(jìn)行層次聚類(lèi)。
K-means 聚類(lèi):與 K-means 聚類(lèi)結(jié)合,首先進(jìn)行層次聚類(lèi),再進(jìn)行 K-means 聚類(lèi)。
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